24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0846 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0846  CBS domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  323  7e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.323025  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1575  CBS domain-containing protein  93.12 
 
 
160 aa  306  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000157706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1100  CBS domain-containing protein  91.88 
 
 
160 aa  303  7e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0057  signal transduction protein  57.59 
 
 
158 aa  209  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0922375  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0668  CBS domain-containing protein  57.59 
 
 
158 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1793  signal transduction protein  57.59 
 
 
158 aa  206  9e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0108  CBS domain-containing protein  56.33 
 
 
158 aa  204  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0099  CBS domain containing protein  24.84 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  28.1 
 
 
221 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  30.95 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  30.16 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  26.27 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  24.81 
 
 
227 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.34 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
225 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0432  CBS domain containing protein  25.19 
 
 
163 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05465  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.4 
 
 
426 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  39.29 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88034  predicted protein  30.25 
 
 
530 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  34.48 
 
 
139 aa  42  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  31.18 
 
 
378 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  31.18 
 
 
378 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  29.41 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1436  MgtE intracellular region  25.71 
 
 
425 aa  40.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000684076  decreased coverage  0.0000760195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>