22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1575 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1575  CBS domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  323  6e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000157706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0846  CBS domain-containing protein  93.12 
 
 
160 aa  306  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.323025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1100  CBS domain-containing protein  93.12 
 
 
160 aa  304  3e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0668  CBS domain-containing protein  59.49 
 
 
158 aa  215  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0057  signal transduction protein  59.49 
 
 
158 aa  213  8e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0922375  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1793  signal transduction protein  58.86 
 
 
158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0108  CBS domain-containing protein  57.59 
 
 
158 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0099  CBS domain containing protein  24.84 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 
221 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0953  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  32.73 
 
 
455 aa  43.9  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0157605  hitchhiker  0.00000184283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  24.58 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  23.26 
 
 
227 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  27.2 
 
 
144 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1710  magnesium transporter  36.26 
 
 
459 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  28 
 
 
144 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
391 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
391 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  25 
 
 
133 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1436  MgtE intracellular region  25.71 
 
 
425 aa  40.8  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000684076  decreased coverage  0.0000760195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  28.41 
 
 
425 aa  40.8  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  26.12 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  23.02 
 
 
154 aa  40.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>