23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0108 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0108  CBS domain-containing protein  100 
 
 
158 aa  322  9e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0668  CBS domain-containing protein  93.67 
 
 
158 aa  306  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1793  signal transduction protein  94.3 
 
 
158 aa  306  8e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0057  signal transduction protein  70.89 
 
 
158 aa  245  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0922375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1100  CBS domain-containing protein  58.23 
 
 
160 aa  210  7e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1575  CBS domain-containing protein  57.59 
 
 
160 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000157706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0846  CBS domain-containing protein  56.33 
 
 
160 aa  204  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.323025  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0099  CBS domain containing protein  32.81 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  28.99 
 
 
427 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  31.5 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0432  CBS domain containing protein  26.28 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05465  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  31.54 
 
 
217 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  25.45 
 
 
221 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  26.55 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  25.41 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  27.46 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  28.57 
 
 
319 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  23.74 
 
 
155 aa  41.2  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  29.81 
 
 
132 aa  41.2  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  28.09 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  24.11 
 
 
322 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  29.7 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  22.67 
 
 
321 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>