20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0668 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0668  CBS domain-containing protein  100 
 
 
158 aa  323  5e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0108  CBS domain-containing protein  93.67 
 
 
158 aa  306  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1793  signal transduction protein  91.77 
 
 
158 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0057  signal transduction protein  72.78 
 
 
158 aa  248  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0922375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1100  CBS domain-containing protein  60.13 
 
 
160 aa  216  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1575  CBS domain-containing protein  59.49 
 
 
160 aa  215  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000157706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0846  CBS domain-containing protein  57.59 
 
 
160 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.323025  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0099  CBS domain containing protein  32.03 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  33.8 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  28.26 
 
 
427 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  31.5 
 
 
217 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  27.87 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0432  CBS domain containing protein  27.34 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05465  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  24.8 
 
 
221 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  26.55 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  26.23 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  28.57 
 
 
319 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  31.68 
 
 
150 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  28.85 
 
 
132 aa  41.6  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  22.52 
 
 
321 aa  40.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>