23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1100 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1100  CBS domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  323  8.000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1575  CBS domain-containing protein  93.12 
 
 
160 aa  304  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000157706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0846  CBS domain-containing protein  91.88 
 
 
160 aa  303  7e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.323025  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0668  CBS domain-containing protein  60.13 
 
 
158 aa  216  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0057  signal transduction protein  60.13 
 
 
158 aa  214  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0922375  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1793  signal transduction protein  59.49 
 
 
158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0108  CBS domain-containing protein  58.23 
 
 
158 aa  210  7e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0099  CBS domain containing protein  24.84 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 
221 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  28 
 
 
144 aa  44.3  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  24.58 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  28.8 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1436  MgtE intracellular region  25.71 
 
 
425 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000684076  decreased coverage  0.0000760195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0432  CBS domain containing protein  27.48 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05465  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.58 
 
 
426 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.34 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2434  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0700724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  22.48 
 
 
227 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  38 
 
 
218 aa  41.6  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  39.66 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  32.53 
 
 
228 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  26.42 
 
 
133 aa  40.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  39.29 
 
 
138 aa  40.4  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>