35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1274 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1274  nitrogenase subunit NifH (ATPase)-like protein  100 
 
 		 334 aa  692    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1445  hypothetical protein  34.72 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000261695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1312  hypothetical protein  33.72 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0438  hypothetical protein  28.23 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.603444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3753  hypothetical protein  26.84 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3559  hypothetical protein  26.44 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.508417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2410  hypothetical protein  26.15 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2155  hypothetical protein  27.62 
 
 		 327 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.555685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2742  hypothetical protein  26.98 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3619  hypothetical protein  24.28 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2845  hypothetical protein  24.78 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000017407  normal  0.0167858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36560  hypothetical protein  22.95 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000556158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3146  hypothetical protein  21.71 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0545359  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0201  hypothetical protein  23.32 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.292732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18050  hypothetical protein  21.88 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.225388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0926  hypothetical protein  21.33 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.619837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3808  hypothetical protein  34.21 
 
 		 545 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0248  hypothetical protein  33.68 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  30.89 
 
 		 657 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4951  squalene-hopene cyclase  30.08 
 
 		 657 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736263  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2394  squalene-hopene cyclase  30.89 
 
 		 657 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2100  squalene-hopene cyclase  30.89 
 
 		 651 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  30.89 
 
 		 657 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  30.89 
 
 		 657 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1409  squalene-hopene cyclase  30.89 
 
 		 657 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.525884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1129  squalene-hopene cyclase  30.89 
 
 		 657 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1490  squalene-hopene cyclase  30.89 
 
 		 651 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  28.78 
 
 		 689 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3175  squalene-hopene cyclase  30.08 
 
 		 657 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  25.66 
 
 		 695 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4148  squalene-hopene cyclase  30.08 
 
 		 669 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146424  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2359  squalene-hopene cyclase  30.89 
 
 		 657 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4556  squalene-hopene cyclase  28.46 
 
 		 657 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282201  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5679  squalene-hopene cyclase  28.46 
 
 		 657 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126345  hitchhiker  0.00244558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5180  squalene cyclase  28.46 
 
 		 657 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0421505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>