15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2742 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2742  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2155  hypothetical protein  80.89 
 
 
327 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.555685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2410  hypothetical protein  82.28 
 
 
327 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2845  hypothetical protein  68.45 
 
 
324 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000017407  normal  0.0167858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0438  hypothetical protein  58.13 
 
 
313 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.603444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3753  hypothetical protein  55.31 
 
 
322 aa  332  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0201  hypothetical protein  49.38 
 
 
324 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.292732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0926  hypothetical protein  51.7 
 
 
332 aa  297  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.619837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36560  hypothetical protein  48.77 
 
 
339 aa  281  8.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000556158  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18050  hypothetical protein  51.1 
 
 
320 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.225388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3559  hypothetical protein  49.06 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.508417  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1274  nitrogenase subunit NifH (ATPase)-like protein  26.98 
 
 
334 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0248  hypothetical protein  45.16 
 
 
210 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1312  hypothetical protein  24.71 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1445  hypothetical protein  24.14 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000261695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>