16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0201 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0201  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.292732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0926  hypothetical protein  73.25 
 
 
332 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.619837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36560  hypothetical protein  70.39 
 
 
339 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000556158  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18050  hypothetical protein  58.31 
 
 
320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.225388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2410  hypothetical protein  51.23 
 
 
327 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2845  hypothetical protein  52.81 
 
 
324 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000017407  normal  0.0167858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2155  hypothetical protein  50.62 
 
 
327 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.555685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2742  hypothetical protein  49.38 
 
 
321 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3753  hypothetical protein  50.31 
 
 
322 aa  295  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0438  hypothetical protein  50.47 
 
 
313 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.603444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3559  hypothetical protein  39.43 
 
 
307 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.508417  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0248  hypothetical protein  60.66 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1274  nitrogenase subunit NifH (ATPase)-like protein  23.32 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1445  hypothetical protein  22.82 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000261695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1312  hypothetical protein  26.28 
 
 
346 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3619  hypothetical protein  20.61 
 
 
291 aa  43.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>