15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_18050  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  643    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.225388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0926  hypothetical protein  58.33 
 
 
332 aa  352  7e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.619837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36560  hypothetical protein  57.23 
 
 
339 aa  345  7e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000556158  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0201  hypothetical protein  58.31 
 
 
324 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.292732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2742  hypothetical protein  51.1 
 
 
321 aa  298  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2410  hypothetical protein  50.94 
 
 
327 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2155  hypothetical protein  49.37 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.555685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2845  hypothetical protein  48.59 
 
 
324 aa  272  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000017407  normal  0.0167858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0438  hypothetical protein  45.4 
 
 
313 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.603444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3753  hypothetical protein  43.99 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3559  hypothetical protein  39.94 
 
 
307 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.508417  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0248  hypothetical protein  41.38 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1274  nitrogenase subunit NifH (ATPase)-like protein  23.41 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1312  hypothetical protein  23.84 
 
 
346 aa  59.7  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1445  hypothetical protein  24.3 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000261695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>