15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2410 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2410  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2155  hypothetical protein  86.85 
 
 
327 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.555685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2742  hypothetical protein  82.28 
 
 
321 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2845  hypothetical protein  66.98 
 
 
324 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000017407  normal  0.0167858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0438  hypothetical protein  59.18 
 
 
313 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.603444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3753  hypothetical protein  57.73 
 
 
322 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0201  hypothetical protein  51.23 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.292732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0926  hypothetical protein  51.52 
 
 
332 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.619837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36560  hypothetical protein  49.55 
 
 
339 aa  295  9e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000556158  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18050  hypothetical protein  50.94 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.225388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3559  hypothetical protein  46.35 
 
 
307 aa  228  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.508417  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1274  nitrogenase subunit NifH (ATPase)-like protein  26.15 
 
 
334 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0248  hypothetical protein  45.16 
 
 
210 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1312  hypothetical protein  24.86 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1445  hypothetical protein  24.52 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000261695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>