18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3195 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3195  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  323  7e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0506  phage integrase family protein  38.03 
 
 		 424 aa  102  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  31.51 
 
 		 408 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1271  integrase family protein  34.15 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0155306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  24.24 
 
 		 328 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  28.36 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  36.36 
 
 		 379 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1324  integrase family protein  31.97 
 
 		 423 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000102488 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  25.71 
 
 		 361 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2003  hypothetical protein  52.63 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77331  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  31.15 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 341 aa  42.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  32.17 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.44 
 
 		 315 aa  41.6  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2299  phage integrase  25 
 
 		 342 aa  41.2  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 283 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 283 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  26.96 
 
 		 322 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>