48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2267 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2267  uroporphyrinogen-III synthase-like  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0514  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  57.33 
 
 
230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2749  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  56 
 
 
227 aa  241  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0539  uroporphyrinogen III synthase HEM4  57.4 
 
 
226 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0977587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0359  uroporphyrinogen-III synthase  52.42 
 
 
250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0073  Fe-S protein-like protein  42.98 
 
 
231 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.027205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  29.56 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  27.18 
 
 
520 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  28.16 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000478387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.51 
 
 
526 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0928  uroporphyrinogen-III synthase  36.19 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3677  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.02 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.4 
 
 
491 aa  55.5  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0496  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.15 
 
 
552 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  26.82 
 
 
513 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  26.61 
 
 
276 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0619  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.49 
 
 
607 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0627947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  24.03 
 
 
567 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.59 
 
 
509 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6129  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.12 
 
 
604 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143048  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  23.2 
 
 
558 aa  49.3  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  26.89 
 
 
237 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.45 
 
 
569 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.45 
 
 
571 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.83 
 
 
528 aa  46.6  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2012  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.98 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0263  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.94 
 
 
526 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240357  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0550  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen- III C-methyltransferase  22.61 
 
 
526 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  23.05 
 
 
565 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8324  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.66 
 
 
594 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.04 
 
 
554 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.04 
 
 
554 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.04 
 
 
554 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  26.18 
 
 
513 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.17 
 
 
492 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2731  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  24.49 
 
 
563 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510631  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  29.41 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1103  uroporphyrinogen-III synthase  27.63 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0908711  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  21.55 
 
 
516 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.55 
 
 
511 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25 
 
 
505 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  24.46 
 
 
272 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.51 
 
 
513 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  22.13 
 
 
492 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  21.65 
 
 
577 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0487  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.99 
 
 
607 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188044  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.2 
 
 
508 aa  42  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.22 
 
 
510 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>