28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0539 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0539  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 226 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0977587  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0514  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  60.54 
 
 		 230 aa  277  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2749  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  61.95 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2267  uroporphyrinogen-III synthase-like  57.4 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0359  uroporphyrinogen-III synthase  56.25 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0073  Fe-S protein-like protein  44.25 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.027205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  30.05 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2012  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.69 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  25.43 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000478387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0928  uroporphyrinogen-III synthase  33.57 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  29.9 
 
 		 520 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.74 
 
 		 511 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  26.37 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.56 
 
 		 491 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  27.31 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  27.31 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3677  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.58 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  28.65 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  25.11 
 
 		 558 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.14 
 
 		 508 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2491  uroporphyrinogen-III synthase  31.51 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  20.91 
 
 		 497 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.97 
 
 		 519 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8324  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.42 
 
 		 594 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.81 
 
 		 528 aa  42  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0496  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.51 
 
 		 552 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1364  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.47 
 
 		 264 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.222114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>