27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0359 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0359  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0073  Fe-S protein-like protein  53.74 
 
 
231 aa  241  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.027205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0514  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  54.15 
 
 
230 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2749  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  51.74 
 
 
227 aa  229  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0539  uroporphyrinogen III synthase HEM4  56.25 
 
 
226 aa  228  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0977587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2267  uroporphyrinogen-III synthase-like  52.42 
 
 
231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  29.44 
 
 
520 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  28.11 
 
 
266 aa  55.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000478387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  27.93 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.24 
 
 
494 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.655247  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3677  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.67 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.03 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.66 
 
 
512 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  26.92 
 
 
263 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.08 
 
 
511 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.43 
 
 
513 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.81 
 
 
503 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.26 
 
 
508 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.11 
 
 
506 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0928  uroporphyrinogen-III synthase  32.37 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  24.1 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.09 
 
 
526 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.92 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.97 
 
 
513 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.78 
 
 
528 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2012  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2488  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 
285 aa  42  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000908937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>