25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2749 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2749  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0514  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  63.06 
 
 		 230 aa  287  8e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0539  uroporphyrinogen III synthase HEM4  61.95 
 
 		 226 aa  268  5e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0977587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2267  uroporphyrinogen-III synthase-like  56 
 
 		 231 aa  241  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0359  uroporphyrinogen-III synthase  51.74 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0073  Fe-S protein-like protein  43.72 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.027205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  25.81 
 
 		 266 aa  52  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0928  uroporphyrinogen-III synthase  28.95 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.4 
 
 		 579 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  27.68 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000478387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3677  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.21 
 
 		 255 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.49 
 
 		 528 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1164  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.59 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.605795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.02 
 
 		 569 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.71 
 
 		 516 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0619  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  23.08 
 
 		 607 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0627947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  23.85 
 
 		 567 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.02 
 
 		 554 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.02 
 
 		 571 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.02 
 
 		 554 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.02 
 
 		 554 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  24.51 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2012  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.14 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  26.87 
 
 		 520 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8324  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.53 
 
 		 594 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>