134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1443 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1443  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  40.94 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  42.86 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  41.32 
 
 
121 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  47.42 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  41.44 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  41.53 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  39.17 
 
 
135 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  37.41 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  33.61 
 
 
139 aa  84.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  51.28 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  39.17 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  32.26 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  32.26 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  32.58 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  41.57 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  39.45 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  34.45 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  39.76 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  34.19 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  34.13 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  38.78 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  35.04 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  38.78 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2306  protein of unknown function DUF454  33.96 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000646681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  31.62 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1072  protein of unknown function DUF454  30.36 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  41.89 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1045  hypothetical protein  45.21 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000150316  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  37.37 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  34.95 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  34.95 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  34.95 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  34.95 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  34.95 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  34.95 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  34.95 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  31.86 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  33.05 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0795  hypothetical protein  26.09 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  42.65 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  40.26 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1530  hypothetical protein  46.59 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.225714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  34.44 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  34.44 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  34.44 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  34.44 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  43.06 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05350  hypothetical protein  30.84 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  41.18 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  39.47 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  28.97 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  34.07 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  33.98 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4200  hypothetical protein  30.91 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00544524  normal  0.158508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  37.18 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  36.71 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0848  hypothetical protein  31.48 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.225476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  42.62 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  36.25 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0722  hypothetical protein  29.21 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2214  hypothetical protein  27.34 
 
 
202 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345545  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  29.31 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2304  hypothetical protein  35.96 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000252834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  46.67 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0981  protein of unknown function DUF454  30.77 
 
 
125 aa  60.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208554  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1454  hypothetical protein  31.52 
 
 
165 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0600527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  30.17 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1113  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  41.38 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  35.9 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  37.66 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2617  hypothetical protein  48.98 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000233192  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  35.44 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4381  hypothetical protein  35.44 
 
 
131 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1767  protein of unknown function DUF454  38.46 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000313735  hitchhiker  0.0045444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2576  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000163875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  37.33 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2692  hypothetical protein  46.94 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000125494  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4856  hypothetical protein  31.48 
 
 
185 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.715473  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2237  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000431925  hitchhiker  0.000763101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1774  protein of unknown function DUF454  36.47 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.486547  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2502  hypothetical protein  37.21 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0524  hypothetical protein  37.7 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.286047  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  32.14 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  37.7 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  30.11 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  30.21 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  38.33 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  29.03 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0292  hypothetical protein  31.58 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.176418 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  26.85 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  31.09 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0042  hypothetical protein  29.59 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  32.29 
 
 
181 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1003  hypothetical protein  30.11 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4220  hypothetical protein  30.11 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2725  protein of unknown function DUF454  41.05 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  29.36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>