24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2427 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2427  terminase large subunit  100 
 
 		 342 aa  711    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5696  PBSX family phage terminase large subunit  81.27 
 
 		 440 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1463  Phage terminase, large subunit, PBSX  60.5 
 
 		 417 aa  411  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.8452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1143  phage terminase, large subunit, PBSX family  37.99 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0309  PBSX family phage terminase large subunit  47.14 
 
 		 471 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1942  PBSX family phage terminase large subunit  34.12 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16151  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3056  phage terminase, large subunit, PBSX family  36.39 
 
 		 421 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5804  putative phage terminase large subunit  37.81 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0227  PBSX family phage terminase large subunit  35.54 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4099  PBSX family phage terminase large subunit  40 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0633  phage terminase, large subunit, pbsx family  38.24 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041592 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1001  PBSX family phage terminase large subunit  39.01 
 
 		 421 aa  139  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252251 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1150  phage terminase, large subunit, PBSX family  33.18 
 
 		 456 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.467738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2189  hypothetical protein  44.74 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.580181 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3756  PBSX family phage terminase large subunit  33.33 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  0.0951984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  27.94 
 
 		 504 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2354  hypothetical protein  27.6 
 
 		 490 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  41 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  40.95 
 
 		 539 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  36 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011779  BbuZS7_G21  phage terminase, large subunit, pbsx family protein  26.16 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  28.8 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0386  hypothetical protein  36.17 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1426  phage terminase, large subunit, PBSX family  25.56 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>