21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_R0062 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_R0062    100 
 
 		 213 bp  422  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0023  Cobalamin riboswitch  83.78 
 
 		 209 bp  95.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568613  normal  0.0699635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0060    87.5 
 
 		 205 bp  71.9  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0033    97.5 
 
 		 209 bp  71.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0035    97.37 
 
 		 216 bp  67.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0061    91.67 
 
 		 223 bp  63.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0025    85.14 
 
 		 212 bp  60  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.378241  normal  0.0216252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0047    94.12 
 
 		 204 bp  52  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0017  Cobalamin riboswitch  88 
 
 		 193 bp  52  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0020    96.55 
 
 		 199 bp  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216421  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0077    100 
 
 		 194 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0046    100 
 
 		 256 bp  50.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0017    91.67 
 
 		 209 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA2  Cobalamin  100 
 
 		 215 bp  48.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0045    100 
 
 		 198 bp  48.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0072  Cobalamin riboswitch  100 
 
 		 214 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.944702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5655  Cobalamin-2  100 
 
 		 225 bp  46.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0290608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA3  Cobalamin  96.3 
 
 		 194 bp  46.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0139315  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0035    93.55 
 
 		 192 bp  46.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0075    100 
 
 		 205 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.472984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0024  Cobalamin riboswitch  91.43 
 
 		 201 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0727138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>