7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5655 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5655  Cobalamin-2  100 
 
 		 225 bp  446  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0290608  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0035    96.55 
 
 		 216 bp  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA2  Cobalamin  100 
 
 		 215 bp  50.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0072  Cobalamin riboswitch  93.75 
 
 		 214 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.944702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0049    100 
 
 		 208 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0030    100 
 
 		 224 bp  46.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00718589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0062    100 
 
 		 213 bp  46.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>