10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_R0075 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_R0075    100 
 
 		 205 bp  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.472984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0072  Cobalamin riboswitch  86.79 
 
 		 214 bp  161  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.944702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0045    88.24 
 
 		 198 bp  73.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA2  Cobalamin  95.12 
 
 		 215 bp  65.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0020    89.39 
 
 		 199 bp  60  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216421  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0060    93.75 
 
 		 205 bp  48.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0017  Cobalamin riboswitch  100 
 
 		 193 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0077    100 
 
 		 194 bp  46.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0046    100 
 
 		 256 bp  46.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0062    100 
 
 		 213 bp  46.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>