23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_R0077 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_R0077    100 
 
 		 194 bp  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0017  Cobalamin riboswitch  100 
 
 		 193 bp  56  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0035    96.88 
 
 		 216 bp  56  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  100 
 
 		 1155 bp  54  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA2  Cobalamin  100 
 
 		 215 bp  54  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0045    96.77 
 
 		 198 bp  54  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0046    100 
 
 		 256 bp  52  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0041  Cobalamin riboswitch  96.67 
 
 		 213 bp  52  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0020    96.55 
 
 		 199 bp  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216421  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1968  hypothetical protein  100 
 
 		 159 bp  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0255641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1951  hypothetical protein  100 
 
 		 159 bp  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0062    100 
 
 		 213 bp  50.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0072  Cobalamin riboswitch  100 
 
 		 214 bp  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.944702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0060    100 
 
 		 205 bp  48.1  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0023  Cobalamin riboswitch  96.43 
 
 		 209 bp  48.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568613  normal  0.0699635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0063    96.3 
 
 		 206 bp  46.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0043  Cobalamin riboswitch  100 
 
 		 218 bp  46.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0075    100 
 
 		 205 bp  46.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.472984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0050    100 
 
 		 209 bp  46.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193277  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0018    100 
 
 		 222 bp  46.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.715719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2207  hypothetical protein  96.3 
 
 		 267 bp  46.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA3  Cobalamin  93.55 
 
 		 194 bp  46.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0139315  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0034    96.3 
 
 		 189 bp  46.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00364064  hitchhiker  0.00265886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>