9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_R0047 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_R0047    100 
 
 		 204 bp  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0033    92.86 
 
 		 209 bp  79.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0024  Cobalamin riboswitch  90.91 
 
 		 201 bp  69.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0727138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0061    97.14 
 
 		 223 bp  61.9  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0025    94.44 
 
 		 212 bp  56  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.378241  normal  0.0216252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0060    100 
 
 		 205 bp  52  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0062    94.12 
 
 		 213 bp  52  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743269  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0020    96.43 
 
 		 199 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216421  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0023  Cobalamin riboswitch  96.3 
 
 		 209 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568613  normal  0.0699635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>