49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3459 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  100 
 
 		 78 aa  154  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  51.52 
 
 		 71 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  46.27 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  46.27 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  54.55 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  44.62 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  46.03 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  48.39 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  44.12 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  44.78 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  45.16 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  46.15 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  38.81 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  45.45 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  41.18 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  46.97 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1493  hypothetical protein  39.06 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  45.59 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1249  protein of unknown function DUF1458  44.26 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2067  protein of unknown function DUF1458  38.33 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1223  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000254328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  40.62 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2071  hypothetical protein  40.32 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416333  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  43.94 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  34.38 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  42.65 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.373756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1790  hypothetical protein  40.32 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0625  hypothetical protein  37.7 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0307  hypothetical protein  46.15 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0658  hypothetical protein  30.3 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.870127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  35.94 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  34.85 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  32.81 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  34.38 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  33.85 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  34.38 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1621  protein of unknown function DUF1458  32.81 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694094  normal  0.69633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10384  protein transport protein secE2  36.36 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.96604e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  32.79 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  32.81 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3058  hypothetical protein  34.38 
 
 		 69 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2873  hypothetical protein  34.43 
 
 		 71 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.272861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  37.29 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  29.23 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2258  hypothetical protein  38 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266107  normal  0.0441451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  32.31 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  36.36 
 
 		 70 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>