36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10384 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10384  protein transport protein secE2  100 
 
 
71 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.96604e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  58.46 
 
 
70 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.373756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  58.46 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2071  hypothetical protein  47.62 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416333  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1790  hypothetical protein  48.48 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  42.65 
 
 
72 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  42.42 
 
 
71 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  43.08 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0307  hypothetical protein  48.44 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  41.94 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  34.92 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  35.48 
 
 
74 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  28.57 
 
 
70 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  36.92 
 
 
66 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  36.51 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  31.25 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  31.34 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3026  protein of unknown function DUF1458  40 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0262302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3012  hypothetical protein  36.92 
 
 
71 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3527  hypothetical protein  29.69 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  34.92 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2497  protein of unknown function DUF1458  34.38 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0549569  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  36.36 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  32.81 
 
 
67 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  32.81 
 
 
67 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  32.81 
 
 
67 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0020  protein of unknown function DUF1458  34.38 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  32.81 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  31.25 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0195  hypothetical protein  36.92 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  28.57 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2453  protein of unknown function DUF1458  35.82 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.149343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  30.16 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.959697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>