106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1232 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  100 
 
 
74 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  72.46 
 
 
69 aa  104  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  53.73 
 
 
70 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2070  protein of unknown function DUF1458  47.83 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  48.44 
 
 
67 aa  67.8  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1493  hypothetical protein  45 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  40.91 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  44.26 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1249  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  48.39 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0625  hypothetical protein  43.33 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  41.27 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1223  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000254328  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  41.94 
 
 
72 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2071  hypothetical protein  39.68 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416333  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  38.81 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  39.06 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2067  protein of unknown function DUF1458  39.34 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  38.81 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.373756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1790  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0829  hypothetical protein  37.88 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  41.27 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0100  hypothetical protein  39.68 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  37.93 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  39.34 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  35.48 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  37.1 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  36.07 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00470  hypothetical protein  41.27 
 
 
71 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.654472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  32.84 
 
 
67 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  35.48 
 
 
69 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0040  hypothetical protein  41.27 
 
 
71 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.224078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0101  hypothetical protein  39.68 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000474292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  29.85 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  36.36 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  39.34 
 
 
70 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  29.85 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  29.85 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02080  hypothetical protein  42.86 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0923  hypothetical protein  36.51 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  39.06 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2873  hypothetical protein  32.79 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.272861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3026  protein of unknown function DUF1458  35.38 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0262302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0086  hypothetical protein  38.1 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3012  hypothetical protein  39.68 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  34.85 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  31.82 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0101  hypothetical protein  38.1 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3527  hypothetical protein  34.33 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2992  hypothetical protein  34.33 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  40.98 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  34.85 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0155  hypothetical protein  33.33 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.275078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  36.36 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0307  hypothetical protein  38.71 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3195  hypothetical protein  31.88 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0037  hypothetical protein  33.33 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2980  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0104  hypothetical protein  38.1 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  31.82 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1015  hypothetical protein  32.26 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.687737  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1305  hypothetical protein  37.7 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268431  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  34.33 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10384  protein transport protein secE2  35.48 
 
 
71 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.96604e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2011  hypothetical protein  33.87 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  32.26 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1866  protein of unknown function DUF1458  41.54 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5579  hypothetical protein  30.16 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  30.3 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  30.65 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4204  protein of unknown function DUF1458  35.29 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202161  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  32.26 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4314  protein of unknown function DUF1458  35.29 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.302415  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  31.34 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  34.43 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2497  protein of unknown function DUF1458  38.1 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0549569  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0177  hypothetical protein  36.92 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0882703  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1287  hypothetical protein  32.26 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1315  hypothetical protein  34.43 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76957  hitchhiker  0.00854236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3058  hypothetical protein  30.65 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0020  protein of unknown function DUF1458  35.48 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2524  hypothetical protein  32.26 
 
 
84 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3647  hypothetical protein  30.16 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2377  hypothetical protein  32.26 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.836659  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2419  hypothetical protein  32.26 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11529  hypothetical protein  29.69 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  32.26 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2762  protein of unknown function DUF1458  32.26 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  32.26 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  25 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4069  hypothetical protein  32.84 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1941  hypothetical protein  31.15 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453713  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  26.56 
 
 
69 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1868  hypothetical protein  31.15 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5265  hypothetical protein  31.15 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604284  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  29.03 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0051  protein of unknown function DUF1458  42.62 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6124  hypothetical protein  31.15 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>