46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01085 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  130  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  45.45 
 
 
78 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  47.62 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  46.03 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  49.25 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  39.39 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  42.42 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  39.06 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  36.51 
 
 
70 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  37.5 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  36.07 
 
 
69 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10384  protein transport protein secE2  36.92 
 
 
71 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.96604e-18  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1941  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1868  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1954  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6124  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1493  hypothetical protein  36.67 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5265  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604284  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1978  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0375499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  33.85 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  33.87 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  31.75 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1315  hypothetical protein  29.69 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76957  hitchhiker  0.00854236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  32.81 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  30.77 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  30.77 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  30.77 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  29.23 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  29.69 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  39.06 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1223  hypothetical protein  36.67 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000254328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  37.5 
 
 
71 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  31.15 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  39.06 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2067  protein of unknown function DUF1458  34.43 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2524  hypothetical protein  28.12 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.373756 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2377  hypothetical protein  28.12 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.836659  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2419  hypothetical protein  28.12 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  30.77 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  29.69 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3058  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>