41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1669 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  141  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1621  protein of unknown function DUF1458  60 
 
 
68 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694094  normal  0.69633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0658  hypothetical protein  59.09 
 
 
67 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.870127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  55.38 
 
 
68 aa  77  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  47.69 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  54.55 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  57.81 
 
 
69 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  47.69 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  44.62 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  44.62 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  45.45 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  40.91 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2258  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266107  normal  0.0441451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  41.27 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000872393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  39.68 
 
 
69 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  35.29 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  38.1 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2067  protein of unknown function DUF1458  32.2 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  34.92 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  36.76 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  41.27 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  39.39 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  31.75 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  32.84 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  38.46 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  33.87 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3623  protein of unknown function DUF1458  36.36 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675874  normal  0.0186505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1147  hypothetical protein  38.1 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0963984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  31.25 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  35.94 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  32.84 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  33.87 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  35.82 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11529  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1249  protein of unknown function DUF1458  31.67 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  34.33 
 
 
82 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  30.77 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  31.34 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1944  hypothetical protein  31.75 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307456  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0268  hypothetical protein  36.07 
 
 
69 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>