51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1437 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  52.31 
 
 		 67 aa  84  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  57.81 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 		 68 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0658  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.870127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1621  protein of unknown function DUF1458  51.56 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694094  normal  0.69633 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2258  hypothetical protein  63.08 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266107  normal  0.0441451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  43.28 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  46.97 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  38.81 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  35.82 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  41.18 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  42.19 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  39.68 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  40.32 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  34.85 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  31.75 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  35.94 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  34.33 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  31.75 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  33.85 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  34.92 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10384  protein transport protein secE2  36.51 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.96604e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  31.82 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  31.75 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  32.26 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  31.75 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0234  hypothetical protein  30.16 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.970646  normal  0.774403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  34.92 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  37.1 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  29.69 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  32.81 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  35.48 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  30.65 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  29.69 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3395  protein of unknown function DUF1458  40.62 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.42441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.373756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  36.51 
 
 		 70 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  27.27 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1305  hypothetical protein  29.69 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268431  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  32.79 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  32.31 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1223  hypothetical protein  28.81 
 
 		 64 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000254328  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  36.51 
 
 		 70 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>