65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2262 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  100 
 
 
68 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1621  protein of unknown function DUF1458  77.94 
 
 
68 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694094  normal  0.69633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  63.08 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0658  hypothetical protein  61.54 
 
 
67 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.870127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  55.38 
 
 
70 aa  77  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2258  hypothetical protein  49.23 
 
 
78 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266107  normal  0.0441451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  43.08 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  41.54 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  43.28 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  40 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  36.76 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  36.76 
 
 
68 aa  53.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  38.24 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0234  hypothetical protein  36.76 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.970646  normal  0.774403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  38.24 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  39.71 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  39.71 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  38.24 
 
 
68 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  38.24 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  35.29 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  40.91 
 
 
70 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  32.35 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1305  hypothetical protein  33.82 
 
 
68 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268431  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  35.29 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  30.77 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0268  hypothetical protein  35.29 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0772  protein of unknown function DUF1458  36.92 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  36.76 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000872393  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1287  hypothetical protein  34.92 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  37.29 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  37.5 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  35.29 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  30.88 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3395  protein of unknown function DUF1458  33.82 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.42441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  32.35 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3058  hypothetical protein  33.82 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2504  protein of unknown function DUF1458  35.29 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512354  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  26.47 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3195  hypothetical protein  32.35 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3623  protein of unknown function DUF1458  32.35 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675874  normal  0.0186505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1147  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0963984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  33.82 
 
 
67 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  33.82 
 
 
68 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  33.85 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3527  hypothetical protein  39.71 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6124  hypothetical protein  30.88 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1941  hypothetical protein  30.88 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1954  hypothetical protein  30.88 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  35.29 
 
 
70 aa  40.8  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  30.88 
 
 
73 aa  40.8  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3026  protein of unknown function DUF1458  32.35 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0262302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1868  hypothetical protein  30.88 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  29.23 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  30.77 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11529  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5265  hypothetical protein  30.88 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604284  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1978  hypothetical protein  30.88 
 
 
69 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0375499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1944  hypothetical protein  32.35 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307456  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  27.27 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1315  hypothetical protein  30.88 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76957  hitchhiker  0.00854236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  31.25 
 
 
70 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>