71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2854 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  97.01 
 
 
67 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  89.55 
 
 
71 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  47.69 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  46.27 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  38.81 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  46.03 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  38.81 
 
 
69 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  43.08 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  34.85 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0658  hypothetical protein  37.88 
 
 
67 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.870127  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  37.88 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  41.54 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  45.31 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1621  protein of unknown function DUF1458  35.38 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694094  normal  0.69633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  36.92 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  40.62 
 
 
69 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  33.85 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  40.62 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  40.32 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2011  hypothetical protein  43.75 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  37.88 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  39.06 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  38.1 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  40 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  41.54 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1493  hypothetical protein  38.33 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  39.06 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  39.06 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3623  protein of unknown function DUF1458  35.94 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675874  normal  0.0186505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0234  hypothetical protein  40.62 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.970646  normal  0.774403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2075  hypothetical protein  32.81 
 
 
105 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  37.5 
 
 
70 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  35.48 
 
 
70 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000872393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  35.48 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  37.5 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1249  protein of unknown function DUF1458  36.07 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  37.29 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  30.3 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  34.85 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  32.31 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  39.06 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  40.62 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5579  hypothetical protein  37.29 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2419  hypothetical protein  30.77 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2377  hypothetical protein  30.77 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.836659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  34.92 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1287  hypothetical protein  32.81 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2317  protein of unknown function DUF1458  34.38 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2524  hypothetical protein  31.25 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1942  hypothetical protein  35.94 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00110853  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  37.5 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5265  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604284  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2067  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6124  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1941  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1954  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1868  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2258  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266107  normal  0.0441451 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1315  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76957  hitchhiker  0.00854236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1978  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0375499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  35.48 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1305  hypothetical protein  35.38 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268431  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  39.06 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  32.35 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  30.77 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  30.77 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  37.31 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.373756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2992  hypothetical protein  35.48 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4069  hypothetical protein  34.38 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  35.94 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>