24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3035 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  100 
 
 
67 aa  131  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  38.81 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  40.3 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  46.97 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  44.78 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  45.45 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  35.82 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  49.25 
 
 
66 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  43.28 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1621  protein of unknown function DUF1458  42.42 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694094  normal  0.69633 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  45.59 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0658  hypothetical protein  34.33 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.870127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  34.85 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2258  hypothetical protein  46.27 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266107  normal  0.0441451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  39.39 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  33.85 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  36.36 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  35.82 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  30.77 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0234  hypothetical protein  37.88 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.970646  normal  0.774403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  33.85 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1305  hypothetical protein  37.31 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268431  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>