31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1223 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1223  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  127  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000254328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0625  hypothetical protein  59.68 
 
 
64 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1249  protein of unknown function DUF1458  57.81 
 
 
64 aa  80.9  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1493  hypothetical protein  59.38 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  61.67 
 
 
67 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  58.33 
 
 
70 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  56.67 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2067  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 
64 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  45 
 
 
74 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  40 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  38.33 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  45.9 
 
 
77 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  36.67 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  33.9 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  32.2 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  42.11 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  35 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  32.2 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  36.67 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  36.67 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  36.67 
 
 
70 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3647  hypothetical protein  35.59 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  32.2 
 
 
71 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  28.81 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2071  hypothetical protein  32.2 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416333  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00470  hypothetical protein  35.71 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.654472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  32.2 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0040  hypothetical protein  33.9 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.224078  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  28.81 
 
 
69 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  30.51 
 
 
82 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>