28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0625 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0625  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1493  hypothetical protein  67.74 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1223  hypothetical protein  59.68 
 
 		 64 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000254328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1249  protein of unknown function DUF1458  57.14 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  63.33 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  58.33 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2067  protein of unknown function DUF1458  54.84 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  56.67 
 
 		 70 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  43.33 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  37.7 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  37.7 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  33.9 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  33.9 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  40.32 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  35.71 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2071  hypothetical protein  35.59 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416333  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  32.79 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1015  hypothetical protein  33.93 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.687737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  33.9 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2873  hypothetical protein  32.14 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.272861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  41.07 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0101  hypothetical protein  32.14 
 
 		 71 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000474292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  28.33 
 
 		 67 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0923  hypothetical protein  32.14 
 
 		 71 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0104  hypothetical protein  30.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0040  hypothetical protein  30.36 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.224078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0101  hypothetical protein  30.36 
 
 		 71 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0086  hypothetical protein  30.36 
 
 		 71 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>