62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2497 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2497  protein of unknown function DUF1458  100 
 
 		 66 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0549569  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1866  protein of unknown function DUF1458  78.46 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2762  protein of unknown function DUF1458  72.31 
 
 		 66 aa  99.4  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0020  protein of unknown function DUF1458  75.38 
 
 		 76 aa  97.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2453  protein of unknown function DUF1458  73.85 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.149343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3395  protein of unknown function DUF1458  42.19 
 
 		 71 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.42441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  35.94 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4069  hypothetical protein  39.06 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  35.38 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  39.06 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  31.25 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3012  hypothetical protein  40.58 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686595  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  40 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  35.94 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  39.06 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  35.38 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  38.1 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  31.25 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  34.38 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1315  hypothetical protein  34.38 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76957  hitchhiker  0.00854236 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2524  hypothetical protein  32.81 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2377  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.836659  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2419  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  37.5 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  37.5 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1868  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4204  protein of unknown function DUF1458  39.06 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4314  protein of unknown function DUF1458  39.06 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.302415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10384  protein transport protein secE2  34.38 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.96604e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1954  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1941  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453713  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6124  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2075  hypothetical protein  31.25 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5265  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604284  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2504  protein of unknown function DUF1458  31.25 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000872393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  32.81 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2992  hypothetical protein  38.1 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1978  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0375499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0195  hypothetical protein  36.36 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  31.25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  35.94 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2011  hypothetical protein  28.12 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2317  protein of unknown function DUF1458  32.81 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1305  hypothetical protein  35.38 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268431  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0268  hypothetical protein  36.21 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  36.36 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.373756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1942  hypothetical protein  32.81 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00110853  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  29.69 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  31.25 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1944  hypothetical protein  34.92 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307456  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  34.38 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11529  hypothetical protein  31.75 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  33.87 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02080  hypothetical protein  35.48 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  34.48 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>