20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0683 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0683  OstA family protein  100 
 
 		 889 aa  1800    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2302  normal  0.219248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2346  Organic solvent tolerance protein OstA  43.75 
 
 		 993 aa  666    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1768  hypothetical protein  27.19 
 
 		 936 aa  206  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.506869  normal  0.453772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  26.19 
 
 		 842 aa  54.7  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  27.32 
 
 		 892 aa  54.3  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  32.29 
 
 		 842 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 		 1040 aa  52.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 889 aa  51.6  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  26.26 
 
 		 861 aa  50.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  31.31 
 
 		 829 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  22.22 
 
 		 932 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  22.22 
 
 		 934 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  30.68 
 
 		 831 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  23.81 
 
 		 938 aa  46.2  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  25.26 
 
 		 876 aa  45.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  26.03 
 
 		 837 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  25.26 
 
 		 876 aa  45.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  22.22 
 
 		 935 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  26.22 
 
 		 743 aa  44.3  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  39.13 
 
 		 1153 aa  44.3  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>