82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5463 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5463  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.889939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3358  hypothetical protein  79.73 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4183  GreA/GreB family elongation factor  80.41 
 
 		 149 aa  233  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.498006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6959  GreA/GreB family elongation factor  51.54 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0852  hypothetical protein  32.81 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3015  GreA/GreB family elongation factor  38.1 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00240658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0697  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.1 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0524  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.1 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0661  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.1 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0632  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.1 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0629  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.1 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3034  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.1 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00567  hypothetical protein  38.1 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00578  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.1 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0729  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.59 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.309798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0715  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.59 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0775  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.59 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0656  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.59 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1679  GreA/GreB family elongation factor  33.96 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.700958  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0670  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.59 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0851  transcription elongation factor GreA/GreB region  29.69 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0614  nucleoside diphosphate kinase regulator  26.92 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3455  GreA/GreB family elongation factor  37.9 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0942  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.15 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1148  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.37 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0934  GreA/GreB family elongation factor  28.35 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4724  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.07 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186623  normal  0.0958356 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5467  GreA/GreB family elongation factor  32.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.521528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3421  GreA/GreB family elongation factor  26.23 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0429  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.48 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0493  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.48 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1165  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.48 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.29507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0518  GreA/GreB family elongation factor  30.56 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3680  nucleoside diphosphate kinase regulator  26.24 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2202  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.2 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4551  GreA/GreB family elongation factor  27.78 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404649  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2929  nucleoside diphosphate kinase regulator  29.77 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1248  GreA/GreB family elongation factor  28.46 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5468  GreA/GreB family elongation factor  27.61 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.699388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1616  GreA/GreB family elongation factor  28.4 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4181  GreA/GreB family elongation factor  27.45 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4382  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.33 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3662  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.33 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.587976  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000067  regulator of nucleoside diphosphate kinase  30.3 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0657287  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5464  GreA/GreB family elongation factor  24.59 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0938  GreA/GreB family elongation factor  31.13 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2402  GreA/GreB family elongation factor  32.04 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2294  GreA/GreB family elongation factor  32.04 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2805  GreA/GreB family elongation factor  32.04 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75777  normal  0.289356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0510  GreA/GreB family elongation factor  33.88 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0414  GreA/GreB family elongation factor  30.08 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1743  GreA/GreB family elongation factor  29.63 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.100273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2799  GreA/GreB family elongation factor  28.04 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3298  transcription elongation factor GreA/GreB region  32.99 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4254  nucleoside diphosphate kinase regulator  30.47 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0066  GreA/GreB family elongation factor  28.57 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0787591  normal  0.343194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0922  transcription elongation factor GreA/GreB region  25.37 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1684  GreA/GreB family elongation factor  32.03 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1764  GreA/GreB family elongation factor  30.19 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2490  GreA/GreB family elongation factor  28.16 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5337  GreA/GreB family elongation factor  28.46 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.641295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3820  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.33 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1314  GreA/GreB family elongation factor  29.41 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0269  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.25 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0557  GreA/GreB family elongation factor  28.93 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1433  GreA/GreB family elongation factor  29.81 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3467  nucleoside diphosphate kinase regulator  28.46 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0276  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.25 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4145  nucleoside diphosphate kinase regulator  30.51 
 
 		 137 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3357  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  24.79 
 
 		 123 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1714  GreA/GreB family elongation factor  32.89 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000114575  normal  0.140273 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0827  GreA/GreB family elongation factor  29.59 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3058  GreA/GreB family elongation factor  35 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.26553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0283  GreA/GreB family elongation factor  33.33 
 
 		 303 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1935  regulator of nucleoside diphosphate kinase  31.58 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5494  nucleoside diphosphate kinase regulator  34.18 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2844  GreA/GreB family elongation factor  30.77 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163743  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1639  GreA/GreB family elongation factor  31.58 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1714  GreA/GreB family elongation factor  31.58 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00341576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3128  GreA/GreB family elongation factor  29.29 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69630  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.71 
 
 		 134 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6016  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.71 
 
 		 134 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>