33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0560 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0560  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  654    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.15423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2131  hypothetical protein  71.38 
 
 		 304 aa  461  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2109  hypothetical protein  54.88 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1020  hypothetical protein  48.2 
 
 		 304 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0895  hypothetical protein  42.52 
 
 		 297 aa  279  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0421  CopG family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0923305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0998  hypothetical protein  33.8 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.930376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3004  hypothetical protein  33.57 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.073246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2230  hypothetical protein  32.3 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2382  hypothetical protein  30.66 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0540  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2174  hypothetical protein  29.47 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.78837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2276  hypothetical protein  28.33 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000101382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0694  hypothetical protein  31.36 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.135494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2650  hypothetical protein  31.12 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1046  hypothetical protein  31.76 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.899913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2692  hypothetical protein  31.6 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.45501e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3304  hypothetical protein  27.84 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.179298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1524  hypothetical protein  30.48 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0476876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0242  hypothetical protein  27.74 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00206072  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2675  hypothetical protein  29.77 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000384013  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1841  hypothetical protein  30.38 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0720  hypothetical protein  32.17 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0117  hypothetical protein  31 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.256011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2742  hypothetical protein  28.21 
 
 		 295 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00120775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1396  hypothetical protein  26.12 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000166179  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1597  hypothetical protein  28.12 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1208  hypothetical protein  26.03 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000509296  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0712  hypothetical protein  25.93 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1202  hypothetical protein  24.07 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.242848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0067  Uncharacterized conserved protein UCP018688  26.18 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.324653  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0188  hypothetical protein  25.65 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118509  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0405  ribonuclease HII (RNase HII)  24.18 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>