34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0242 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0242  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  604  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00206072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1396  hypothetical protein  37.29 
 
 
300 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000166179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1208  hypothetical protein  35.97 
 
 
300 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000509296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2276  hypothetical protein  31.54 
 
 
303 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000101382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0540  hypothetical protein  26.85 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1046  hypothetical protein  27.3 
 
 
294 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.899913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2382  hypothetical protein  29.08 
 
 
299 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1524  hypothetical protein  30.15 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0476876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2692  hypothetical protein  30.4 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.45501e-19 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2650  hypothetical protein  27.57 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2230  hypothetical protein  27.39 
 
 
301 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2174  hypothetical protein  27.33 
 
 
303 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.78837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3304  hypothetical protein  27.21 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.179298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0694  hypothetical protein  26.17 
 
 
294 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.135494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2742  hypothetical protein  26.25 
 
 
295 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00120775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0421  CopG family transcriptional regulator  27.67 
 
 
300 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0923305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2131  hypothetical protein  27.81 
 
 
304 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0560  hypothetical protein  27.74 
 
 
312 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.15423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1597  hypothetical protein  25.42 
 
 
297 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2109  hypothetical protein  27.34 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1020  hypothetical protein  27.18 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0998  hypothetical protein  22.85 
 
 
299 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.930376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3004  hypothetical protein  30.87 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.073246  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1841  hypothetical protein  26.1 
 
 
307 aa  114  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0895  hypothetical protein  30.1 
 
 
297 aa  112  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0720  hypothetical protein  27.3 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0188  hypothetical protein  27.24 
 
 
330 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118509  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0067  Uncharacterized conserved protein UCP018688  25.54 
 
 
318 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.324653  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1202  hypothetical protein  25.82 
 
 
326 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.242848  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2675  hypothetical protein  30.26 
 
 
296 aa  102  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000384013  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0117  hypothetical protein  25.55 
 
 
283 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.256011  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0405  ribonuclease HII (RNase HII)  26.64 
 
 
328 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0712  hypothetical protein  23.68 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1574  hypothetical protein  19.81 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.95282e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>