35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3004 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3004  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  619  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.073246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2382  hypothetical protein  48.47 
 
 		 299 aa  279  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2230  hypothetical protein  44.93 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2276  hypothetical protein  38.83 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000101382  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1841  hypothetical protein  36.45 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2650  hypothetical protein  36.36 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0540  hypothetical protein  32.77 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0560  hypothetical protein  33.57 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.15423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2131  hypothetical protein  33.11 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2174  hypothetical protein  30.64 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.78837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0694  hypothetical protein  34.32 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.135494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0998  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.930376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1597  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2109  hypothetical protein  28.22 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0117  hypothetical protein  37.02 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.256011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0242  hypothetical protein  30.87 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00206072  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1020  hypothetical protein  27.84 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2742  hypothetical protein  29.73 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00120775  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2675  hypothetical protein  35.9 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000384013  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1208  hypothetical protein  26.58 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000509296  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0895  hypothetical protein  26.48 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1396  hypothetical protein  26.25 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000166179  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0421  CopG family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0923305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3304  hypothetical protein  26.12 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.179298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1524  hypothetical protein  26.12 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0476876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0712  hypothetical protein  25.93 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2692  hypothetical protein  26.8 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.45501e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1046  hypothetical protein  26.96 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.899913  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0405  ribonuclease HII (RNase HII)  28.14 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0067  Uncharacterized conserved protein UCP018688  28.45 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.324653  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1202  hypothetical protein  26.91 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.242848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0720  hypothetical protein  26.01 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0188  hypothetical protein  26.78 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1574  hypothetical protein  23.03 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.95282e-16 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0675  hypothetical protein  23.33 
 
 		 317 aa  42.4  0.01  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.924867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>