34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0188 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0188  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  675    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118509  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0405  ribonuclease HII (RNase HII)  71.88 
 
 
328 aa  489  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1202  hypothetical protein  59.08 
 
 
326 aa  403  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.242848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0540  hypothetical protein  31.17 
 
 
298 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0242  hypothetical protein  27.24 
 
 
299 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00206072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2382  hypothetical protein  30.73 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1524  hypothetical protein  23.2 
 
 
297 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0476876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1046  hypothetical protein  25.63 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.899913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3304  hypothetical protein  21.39 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.179298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2276  hypothetical protein  25.26 
 
 
303 aa  86.3  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000101382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2692  hypothetical protein  26.53 
 
 
297 aa  85.9  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.45501e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3004  hypothetical protein  26.78 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.073246  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1841  hypothetical protein  30.98 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1396  hypothetical protein  27.03 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000166179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2230  hypothetical protein  29.8 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1208  hypothetical protein  27.18 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000509296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1574  hypothetical protein  25 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.95282e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0998  hypothetical protein  28.41 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.930376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2131  hypothetical protein  25.42 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0117  hypothetical protein  32.6 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.256011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2675  hypothetical protein  30.98 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000384013  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1597  hypothetical protein  24.32 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2650  hypothetical protein  28 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0560  hypothetical protein  25.65 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.15423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2109  hypothetical protein  26.13 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0694  hypothetical protein  23.81 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.135494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0895  hypothetical protein  26.88 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0720  hypothetical protein  25.51 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0712  hypothetical protein  24.81 
 
 
300 aa  59.7  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0421  CopG family transcriptional regulator  21.81 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0923305 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2174  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.78837 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1020  hypothetical protein  26.06 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2742  hypothetical protein  27.81 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00120775  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0067  Uncharacterized conserved protein UCP018688  25.39 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.324653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>