33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0405 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0405  ribonuclease HII (RNase HII)  100 
 
 		 328 aa  672    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0188  hypothetical protein  71.88 
 
 		 330 aa  489  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1202  hypothetical protein  58.72 
 
 		 326 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.242848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0540  hypothetical protein  30.34 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2382  hypothetical protein  35.71 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0242  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00206072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2276  hypothetical protein  27.94 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000101382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2230  hypothetical protein  31.87 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2692  hypothetical protein  30.6 
 
 		 297 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.45501e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3004  hypothetical protein  28.14 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.073246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1524  hypothetical protein  30.6 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0476876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1574  hypothetical protein  23.48 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.95282e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0998  hypothetical protein  31.43 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.930376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1046  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.899913  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1841  hypothetical protein  30.22 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1208  hypothetical protein  26.6 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000509296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3304  hypothetical protein  23.05 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.179298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1396  hypothetical protein  25.93 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000166179  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2650  hypothetical protein  29.89 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0694  hypothetical protein  30.29 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.135494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2131  hypothetical protein  26.01 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2675  hypothetical protein  28.77 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000384013  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1597  hypothetical protein  28.26 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2174  hypothetical protein  31.43 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.78837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0895  hypothetical protein  27.47 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0720  hypothetical protein  23.92 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0712  hypothetical protein  24.75 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0421  CopG family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0923305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1020  hypothetical protein  28.41 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2109  hypothetical protein  25.84 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0117  hypothetical protein  28.98 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.256011  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0560  hypothetical protein  24.18 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.15423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2742  hypothetical protein  27.13 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00120775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>