33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1524 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0476876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2692  hypothetical protein  94.61 
 
 		 297 aa  569  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.45501e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3304  hypothetical protein  59.86 
 
 		 293 aa  362  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.179298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1046  hypothetical protein  58.78 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.899913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0720  hypothetical protein  62.2 
 
 		 296 aa  338  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2675  hypothetical protein  32.89 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000384013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0540  hypothetical protein  29.93 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0242  hypothetical protein  30.15 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00206072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2230  hypothetical protein  28.33 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2131  hypothetical protein  32.75 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2276  hypothetical protein  28.04 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000101382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2382  hypothetical protein  29.25 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543034  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0895  hypothetical protein  30.34 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0560  hypothetical protein  30.48 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.15423 
 
 
-
 
NC_002950  PG1841  hypothetical protein  31.58 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2650  hypothetical protein  36.96 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2109  hypothetical protein  29.67 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0998  hypothetical protein  30.42 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.930376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0694  hypothetical protein  29.47 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.135494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2174  hypothetical protein  28.73 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.78837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0421  CopG family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0923305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1020  hypothetical protein  29.82 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1396  hypothetical protein  25.91 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000166179  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2742  hypothetical protein  35.52 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00120775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0117  hypothetical protein  36.26 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.256011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3004  hypothetical protein  26.12 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.073246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1208  hypothetical protein  25.33 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000509296  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1597  hypothetical protein  26.44 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1202  hypothetical protein  29.47 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.242848  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0188  hypothetical protein  23.2 
 
 		 330 aa  89  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118509  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0712  hypothetical protein  30.87 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0405  ribonuclease HII (RNase HII)  30.6 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0067  Uncharacterized conserved protein UCP018688  27.88 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.324653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>