33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0694 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0694  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.135494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0998  hypothetical protein  66.67 
 
 
299 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.930376 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2650  hypothetical protein  65.41 
 
 
293 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1597  hypothetical protein  52.9 
 
 
297 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2174  hypothetical protein  50.34 
 
 
303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.78837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2742  hypothetical protein  45.99 
 
 
295 aa  258  9e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00120775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0117  hypothetical protein  42.86 
 
 
283 aa  222  7e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.256011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0067  Uncharacterized conserved protein UCP018688  36.33 
 
 
318 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.324653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2276  hypothetical protein  31.8 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000101382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2230  hypothetical protein  31.94 
 
 
301 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2382  hypothetical protein  35.14 
 
 
299 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3004  hypothetical protein  34.32 
 
 
297 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.073246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0560  hypothetical protein  31.36 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.15423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1046  hypothetical protein  34.59 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.899913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2131  hypothetical protein  28.67 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0242  hypothetical protein  26.17 
 
 
299 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00206072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0540  hypothetical protein  29.89 
 
 
298 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2675  hypothetical protein  29.07 
 
 
296 aa  122  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000384013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3304  hypothetical protein  30.88 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.179298  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1208  hypothetical protein  27.21 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000509296  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2109  hypothetical protein  28.37 
 
 
298 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1524  hypothetical protein  29.47 
 
 
297 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0476876  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0421  CopG family transcriptional regulator  26.64 
 
 
300 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0923305 
 
 
-
 
NC_002950  PG1841  hypothetical protein  29.93 
 
 
307 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1020  hypothetical protein  30.1 
 
 
304 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1396  hypothetical protein  25.99 
 
 
300 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000166179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2692  hypothetical protein  29.12 
 
 
297 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.45501e-19 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0895  hypothetical protein  27.82 
 
 
297 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0720  hypothetical protein  31.23 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0405  ribonuclease HII (RNase HII)  30.29 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1202  hypothetical protein  24.76 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.242848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0712  hypothetical protein  24.37 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0188  hypothetical protein  23.81 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>