32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00792 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00792  TonB system transport protein ExbD2  100 
 
 		 64 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000845054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  69.35 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.45 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.45 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.45 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.45 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  53.45 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.45 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.45 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.45 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.72 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.72 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.72 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.33 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.88 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.88 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0162  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.88 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  49.15 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  47.37 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  38.98 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 		 116 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  37.04 
 
 		 135 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  38.6 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.03 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  40.68 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  37.29 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.98 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  39.66 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>