54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1322 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  100 
 
 		 1125 bp  821    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1322    100 
 
 		 414 bp  821    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0940643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0869    91.36 
 
 		 216 bp  105  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  94.64 
 
 		 1089 bp  87.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  94.64 
 
 		 1089 bp  87.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  90.77 
 
 		 1089 bp  81.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  90.77 
 
 		 1089 bp  81.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  90.77 
 
 		 1023 bp  81.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  90.77 
 
 		 1089 bp  81.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  90.77 
 
 		 1089 bp  81.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  93.48 
 
 		 1092 bp  67.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4686    93.48 
 
 		 255 bp  67.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.24302  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  93.48 
 
 		 1092 bp  67.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  93.48 
 
 		 1092 bp  67.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  87.69 
 
 		 1113 bp  65.9  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  87.69 
 
 		 1104 bp  65.9  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  87.69 
 
 		 1104 bp  65.9  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  87.69 
 
 		 1113 bp  65.9  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  86.15 
 
 		 1113 bp  58  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  86.21 
 
 		 1086 bp  52  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  86.21 
 
 		 1086 bp  52  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9090    88 
 
 		 1093 bp  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8247    88 
 
 		 642 bp  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8229    88 
 
 		 831 bp  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174563  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  88 
 
 		 1101 bp  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8196    88 
 
 		 1100 bp  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8192    88 
 
 		 792 bp  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8061    88 
 
 		 1096 bp  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00650  isrso5-transposase protein  83.33 
 
 		 342 bp  52  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0193031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  94.12 
 
 		 1098 bp  52  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  96.55 
 
 		 1122 bp  50.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4694  hypothetical protein  96.55 
 
 		 1014 bp  50.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0765    96.43 
 
 		 1113 bp  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2612    85.71 
 
 		 2871 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0337479  normal  0.101338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  85.71 
 
 		 1092 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 		 1083 bp  48.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1080 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1617  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 666 bp  48.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.0770376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1269  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 876 bp  46.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0299945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2905  myo-inositol-1-phosphate synthase  100 
 
 		 1167 bp  46.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>