27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4686 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4686    100 
 
 		 255 bp  505  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.24302  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  99.57 
 
 		 1092 bp  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  99.57 
 
 		 1092 bp  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  98.7 
 
 		 1092 bp  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4739    91.16 
 
 		 595 bp  276  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150445  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4774    90.7 
 
 		 483 bp  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174266  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  79.61 
 
 		 1098 bp  75.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  93.48 
 
 		 1125 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1322    93.48 
 
 		 414 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0940643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2612    100 
 
 		 2871 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0337479  normal  0.101338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2146    100 
 
 		 186 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000363504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4706  hypothetical protein  100 
 
 		 777 bp  52  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>