75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2612 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  100 
 
 		 1092 bp  1792    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2612    100 
 
 		 2871 bp  5691    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0337479  normal  0.101338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  2141    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2146    100 
 
 		 186 bp  355  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000363504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  84.76 
 
 		 1728 bp  244  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0005  putative type I restriction enzyme, R subunit  99.04 
 
 		 360 bp  198  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1311  restriction modification system DNA specificity subunit  83.67 
 
 		 1737 bp  186  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  97.67 
 
 		 1092 bp  77.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1195    100 
 
 		 318 bp  75.8  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  81.95 
 
 		 1089 bp  73.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  81.95 
 
 		 1089 bp  73.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  92 
 
 		 1092 bp  67.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  92 
 
 		 1092 bp  67.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  92 
 
 		 1092 bp  67.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  92 
 
 		 1092 bp  67.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  92 
 
 		 1092 bp  67.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  92 
 
 		 1092 bp  67.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  92 
 
 		 1092 bp  67.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  92 
 
 		 1092 bp  67.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  91.84 
 
 		 1086 bp  65.9  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  91.84 
 
 		 1086 bp  65.9  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  86.76 
 
 		 1092 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  86.76 
 
 		 1092 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  86.76 
 
 		 1092 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  86.76 
 
 		 1092 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1873    86.76 
 
 		 1036 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  86.76 
 
 		 1092 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  86.76 
 
 		 1092 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1253  Type I restriction enzyme EcoAI specificity protein  88.33 
 
 		 1794 bp  63.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00376854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  90.2 
 
 		 1728 bp  61.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0453  remnant of ISRSO5 transposase protein  93.02 
 
 		 585 bp  61.9  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  94.87 
 
 		 1122 bp  61.9  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  90.2 
 
 		 1353 bp  61.9  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  91.3 
 
 		 1071 bp  60  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1063  hypothetical protein  100 
 
 		 249 bp  58  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0757    94.59 
 
 		 558 bp  58  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424284  normal  0.0414971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  91.11 
 
 		 1734 bp  58  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4686    100 
 
 		 255 bp  54  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.24302  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4739    100 
 
 		 595 bp  54  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150445  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  100 
 
 		 1092 bp  54  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  100 
 
 		 1092 bp  54  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0765    90.7 
 
 		 1113 bp  54  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  100 
 
 		 1092 bp  54  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  96.77 
 
 		 1089 bp  54  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  96.77 
 
 		 1023 bp  54  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  96.77 
 
 		 1089 bp  54  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  96.77 
 
 		 1089 bp  54  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  96.77 
 
 		 1089 bp  54  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  94.12 
 
 		 1074 bp  52  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  94.12 
 
 		 1074 bp  52  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  94.12 
 
 		 1074 bp  52  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  94.12 
 
 		 1074 bp  52  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  94.12 
 
 		 1074 bp  52  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1306    94.12 
 
 		 1075 bp  52  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  96.67 
 
 		 732 bp  52  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  96.67 
 
 		 1002 bp  52  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  96.67 
 
 		 729 bp  52  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0640    96.55 
 
 		 1040 bp  50.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4694  hypothetical protein  91.89 
 
 		 1014 bp  50.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  90.24 
 
 		 1839 bp  50.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  93.94 
 
 		 540 bp  50.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>