58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0765 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0765    100 
 
 		 1113 bp  2206    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  87.12 
 
 		 1113 bp  1029    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  87.01 
 
 		 1101 bp  73.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4091    86.84 
 
 		 273 bp  71.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  93.48 
 
 		 1092 bp  67.9  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  84.27 
 
 		 1092 bp  65.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1873    84.27 
 
 		 1036 bp  65.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  84.27 
 
 		 1092 bp  65.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  84.27 
 
 		 1092 bp  65.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  84.27 
 
 		 1092 bp  65.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  84.27 
 
 		 1092 bp  65.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  84.27 
 
 		 1092 bp  65.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  87.72 
 
 		 1881 bp  58  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  87.72 
 
 		 1092 bp  58  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  83.15 
 
 		 1125 bp  58  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3358    90.91 
 
 		 1046 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4703    89.36 
 
 		 870 bp  54  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2612    90.7 
 
 		 2871 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0337479  normal  0.101338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  90.7 
 
 		 1092 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 1080 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  86.21 
 
 		 729 bp  52  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0620    90.48 
 
 		 1095 bp  52  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  92.11 
 
 		 1089 bp  52  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  92.11 
 
 		 1089 bp  52  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  92.11 
 
 		 1089 bp  52  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  92.11 
 
 		 1170 bp  52  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4245  Methylated-DNA-(protein)-cysteine S- methyltransferase DNA binding protein  100 
 
 		 390 bp  52  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  96.55 
 
 		 1029 bp  50.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  82.02 
 
 		 1092 bp  50.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 		 1074 bp  48.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1306    88.64 
 
 		 1075 bp  48.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 		 1074 bp  48.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6939    96.43 
 
 		 1046 bp  48.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022128  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  83.33 
 
 		 732 bp  48.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 		 1074 bp  48.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 		 1074 bp  48.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  83.33 
 
 		 1002 bp  48.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  88.64 
 
 		 1074 bp  48.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6444    93.75 
 
 		 507 bp  48.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1322    96.43 
 
 		 414 bp  48.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0940643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  100 
 
 		 1413 bp  48.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  100 
 
 		 1416 bp  48.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  100 
 
 		 1416 bp  48.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>