32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4091 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007489  RSP_4091    100 
 
 
273 bp  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  87.78 
 
 
1881 bp  91.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  87.78 
 
 
1092 bp  91.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  86.96 
 
 
903 bp  87.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0765    86.84 
 
 
1113 bp  71.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  92 
 
 
1080 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  81.16 
 
 
1125 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  83.87 
 
 
1101 bp  65.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  89.29 
 
 
1092 bp  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1873    89.29 
 
 
1036 bp  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  89.29 
 
 
1092 bp  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  89.29 
 
 
1092 bp  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  89.29 
 
 
1092 bp  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  89.29 
 
 
1092 bp  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4703    86.11 
 
 
870 bp  63.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  89.09 
 
 
1092 bp  61.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  81.58 
 
 
1095 bp  60  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  94.74 
 
 
1095 bp  60  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  84.72 
 
 
1092 bp  56  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  84.72 
 
 
1092 bp  56  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  84.72 
 
 
1092 bp  56  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1746  hypothetical protein  85.48 
 
 
441 bp  52  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0533978  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0620    85.48 
 
 
1095 bp  52  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7298    90.48 
 
 
822 bp  52  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  83.56 
 
 
1089 bp  50.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  83.56 
 
 
1089 bp  50.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  83.56 
 
 
1089 bp  50.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  83.56 
 
 
1170 bp  50.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  81.72 
 
 
864 bp  50.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0493    81.72 
 
 
1077 bp  50.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  82.5 
 
 
1071 bp  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  96.3 
 
 
2310 bp  46.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>