51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1306 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  99.91 
 
 		 1074 bp  2115    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  99.91 
 
 		 1074 bp  2115    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  99.91 
 
 		 1074 bp  2115    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  99.91 
 
 		 1074 bp  2115    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1306    100 
 
 		 1075 bp  2131    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  99.91 
 
 		 1074 bp  2115    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  94.87 
 
 		 1089 bp  61.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  94.87 
 
 		 1089 bp  61.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  94.87 
 
 		 1089 bp  61.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  94.87 
 
 		 1089 bp  61.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  94.87 
 
 		 1170 bp  61.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  94.87 
 
 		 1089 bp  61.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  94.87 
 
 		 1089 bp  61.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  94.87 
 
 		 1089 bp  61.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  94.87 
 
 		 1089 bp  61.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  94.87 
 
 		 1089 bp  61.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6444    92.68 
 
 		 507 bp  58  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2612    94.12 
 
 		 2871 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0337479  normal  0.101338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  94.12 
 
 		 1092 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  92.11 
 
 		 1089 bp  52  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  94.12 
 
 		 1080 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  91.89 
 
 		 936 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  91.89 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  91.67 
 
 		 1086 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  91.67 
 
 		 1086 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0765    88.64 
 
 		 1113 bp  48.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>